genaxxon M3009.0250说明书

genaxxon M3009.0250说明书

genaxxon M3009.0250说明书

SNP Pol DNA Polymerase

货号: M3009.0250

运输:湿冰运输,-20°C 储存

“SNP Pol DNA聚合酶”产品信息

SNP Pol DNA 聚合酶,用于简单、可靠和快速的等位基因特异性鉴别,例如。CRISPR / Cas9 点突变,用于检测不正确的 CRISPR / Cas9 产品,或验证测序结果。SNP Pol DNA 聚合酶具有高度特异性,无论是否存在引物-模板-复合物的错配。错配(点突变)必须位于引物的 3' 端。因此,突变等位基因可以与野生型等位基因准确区分开来——无需测序,因为聚合酶在错配的情况下根本不会扩增。

只需将您的引物放在假定的点突变上(重要:点突变必须在 3' 末端),聚合酶将以几乎 100% 的准确度检测该区域的错配:如果模板碱基与 3' 末端互补引物显示突变,而引物没有,不会发生扩增 – 短时间内 100% 确定!
因此,SNP Pol DNA 聚合酶可以轻松、省时且经济高效地用于点突变的筛选。

变体SNP PolTaq DNA 聚合酶 >具有 5'-3' 核酸酶活性,因此可用于特定水解探针,例如 Taqman® 探针或分子信标。

以*提供测试样品!德国境内无运费。测试样品价格将在产品的第一个订单中退还。

说明
SNP波尔DNA聚合酶>(您好GH狄单核苷酸scrimination) 是一种高度选择性的 DNA 聚合酶。它专为需要高鉴别率的等位基因特异性鉴别而开发:例如在等位基因特异性 PCR (ASA; AS-PCR)、等位基因特异性引物延伸 (AS-PEX)、SNP 分析、基因分型或甲基化- 特异性 PCR (MSP)。许多其他 DNA 聚合酶耐受错配的引物-模板复合物,因此不适合。另一方面,SNP Pol DNA 聚合酶专门区分这些(高辨别力)并仅提供具有匹配引物对的 PCR 产物!Genaxxon SNP Pol 和 SNP PolTaq DNA 聚合酶通过两个等位基因之间的等位基因特异性 PCR 差异高达 100%,并且在简单的 qPCR 后,给出关于存在哪个等位基因的明确结果。因此,

等位基因特异性 PCR 可用于量化野生型序列库或背景中的突变率。NGS确定的突变频率的验证  也可以通过等位基因特异性 PCR 和 SNP Pol DNA 聚合酶来验证。SNP PolTaq DNA 聚合酶非常适用于液体活检 样品的分析 。使用 SNP PolTaq,可以很好地分析和量化癌症突变的存在和频率。

下图:应用说明 SNP Pol DNA 聚合酶

 

我们建议设计具有较短扩增子长度(约 60-200 bp)的引物以获得最佳结果,但更长的扩增子长度也是可能的。如果更长的扩增子 > 500 bp,可能需要添加额外的镁 (+0.5 – 1.5mM)。

SNP Pol DNA 聚合酶(M3009 >或M3061 >)可与非特异性荧光染料(例如 Genaxxon's Green DNA Dye >或 SybrGreen®)一起用于实时 PCR。当使用特定的 PCR 探针时,只能使用 SNP PolTaq DNA 聚合酶,因为只有它们具有 5'-3' 核酸外切酶活性。

凭借我们的高品质 dNTPs Set (M3015.4100) >或Mix (M3016.1010) >或我们的DNA Ladders >以及我们有利的标准琼脂糖 (M3044) >我们可以为您的 PCR 提供其他产品。

SNP Pol DNA 和 SNP Pol DNA 聚合酶的应用领域
– 点突变的监测、验证和检测
– 识别正确或错误的 CRISPR/Cas9 产品
– 测序结果的验证/验证
– 突变的量化(例如 NGS 结果)
– SNP 检测通过等位基因特异性扩增 (ASA) / 等位基因特异性 PCR 
– 亚硫酸氢盐处理的 DNA(CpG 甲基化侧)后的甲基化特异性 PCR (MSP) 
– HLA 基因分型
– 微测序
– 使用水解探针的实时 PCR 
– 实时多重 PCR

– 秀丽隐杆线虫中的 DamID-seq 数据。

作为 ChIP 的替代方案,最近显示通过测序鉴定 DNA 腺嘌呤甲基转移酶 (DamID-seq) 能够表征单个哺乳动物细胞中的结合位点。此外,DamID 可以通过在组织特异性启动子下以受控方式表达 Dam 融合蛋白来实现细胞类型特异性分析。在本报告中,我们提出了一个用户友好的管道来分析秀丽隐杆线虫中的 DamID-seq 数据。

Sharma R、Ritler D、Meister P.
秀丽隐杆线虫发育过程中核组织 DNA 腺嘌呤甲基转移酶鉴定分析的工具。创世纪。2016 年 2 月 4 日。doi:10.1002/dvg.22925。

– 使用 SNPase DNA 聚合酶进行 SNP 基因分型的微量测序可以通过以下描述的程序进行:

Lovmar L、Fredriksson M、Liljedahl U、Sigurdsson S、Syvänen AC。 
通过微型测序和微阵列进行的定量评估揭示了全基因组扩增 DNA 的准确多重 SNP 基因分型。核酸研究。2003;31:e129。

– HiDi DNA 聚合酶的等位基因特异性错配选择性

Drum M、Kranaster R、Ewald C、Blasczyk R、Marx A (2014) 在等位基因和甲基化特异性扩增中具有更高选择性的水生栖热菌 DNA 聚合酶变体。PLoS 一 9(5):e96640。doi:10.1371/journal.pone.0096640